Православных храм расположен в здании бывшей армянской церкви Иоанна Крестителя (Иоанна Предтечи) в Феодосии. Она была построена в XIII—XIV веках рядом с Генуэзской крепостью (Кафой). Православной святыня стала в 1875 году. При советской власти церковь закрыли. Фрески были испорчены, исчезла скульптура. В 1966 году церковь реконструировали.

Храм состоит из двух частей, построенных в разное время. Более старая увенчана восьмигранным барабаном с окнами-бойницами и куполом. Вторая же пристройка находится на стороне главного входа и разделена столбами на три нефа с полукруглыми сводами.

Неф украшен фресками, которые удалось фрагментарно сохранить в первозданном виде.