Основана в 1945 г. на базе Симеизского отделения Пулковской обсерватории. Основная часть обсерватории находится в посёлке Научный. В состав обсерватории входят отдел физики Солнца и малых тел Солнечной системы, отдел внегалактических исследований и гамма-астрономии, отдел радиоастрономии и геодинамики и лаборатория перспективных разработок. Неподалёку от Научного построена станция «Роскосмоса», где ведутся наблюдения за космическим мусором.